Der er en stor del af institutioner for videregående uddannelser i hele Kirgisistan. Dette omfatter omkring syvogtredive offentlige universiteter og atten private universiteter. Fremtrædende universiteter i Kirgisistan bl.a. University of Centralasien og kirgisiske National University.

Krav til ph.d.-uddannelsen indebærer ofte den studerende allerede har fået en kandidatuddannelse. Derudover skal der indsendes en afhandling eller en disputats primært består af originale akademisk forskning. I nogle lande kan dette arbejde engang behøver at blive forsvaret foran et panel.