International doktorgrad i strukturel biologi

The International Doctorate in Structural Biology er en international doktorgrad i samarbejde med universiteterne i Frankfurt og Utrecht. Den blev etableret med en aftale underskrevet af de tre rektorer i 2001. På baggrund af denne aftale anses den ph.d.-titel, som studerende opnår ved afslutningen af uddannelsen, at svare til den, der opnås ved Bijvoet Center for Biomolekylær Forskning og til ph.d. i kemi og biokemi fra universitetet i Frankfurt.

Doktorgradsforløbet sigter mod dannelsen af ph.d.er, der er på forkant med viden og uddannelse inden for moderne undersøgelsesmetoder inden for strukturbiologi, bioteknologi og systembiologi. Det giver et væld af viden til uddannelse af eksperter inden for strukturkemi anvendt på biologiske makromolekyler i opløsning, i fibriller, i membraner eller i celler, og inden for molekylærbiologi til ekspression af isotopisk berigede rekombinante proteiner.

Værtsinstitution

Magnetic Resonance Center (CERM) ved University of Florence er en forskningsinfrastruktur, der støttes af Europa-Kommissionen for at give transnational adgang til biologisk NMR. CERM er et af de første laboratorier i verden for kvalitet af udstyr, produktion og videnskabelig troværdighed inden for strukturel biologi og NMR. Infrastrukturen er unikt udstyret med et stort antal NMR-spektrometre, der spænder fra 1200 MHz ned til 0,01 MHz, gennem 950, 900, 850 WB, 800, 700, 600, 500 og 400 MHz spektrometre. Mange af disse instrumenter er udstyret med en kryoprobe. Det har en specialiseret tradition i undersøgelse af metalloproteiner, især paramagnetiske metalloproteiner. CERM er et kernemedlem af INSTRUCT, den europæiske infrastruktur for integreret strukturel biologi, som omfatter centre for banebrydende teknologi, videnskabelig ekspertise og uddannelse.

Studerende trænes i grænsefladen mellem biologi og uorganisk kemi gennem biocomputing og spektroskopi. Det langsigtede uddannelsesmål er at skabe forskere, der er i stand til at ramme specifikke problemer i en generel kontekst, at betragte multidisciplinaritet som et primært behov og at betragte transnationalt samarbejde som et krav for at udvikle en sammenhængende generation af europæiske videnskabsmænd.

De emner, der ligger til grund for kurset er:

• Kernemagnetisk resonans (i opløsning og i fast tilstand) og røntgenkrystallografi til strukturelle undersøgelser, funktion og dynamik af biologiske makromolekyler, protein-protein-interaktioner;
• Molekylærbiologiske og cellulærbiologiske teknikker til fremstilling og manipulation af proteiner, DNA og bakterielle konsortier;
• udvikling af nye lægemidler gennem lægemiddeldesignteknikker;
• Bioinformatik som en grundlæggende strategi for studiet af kinetiske og termodynamiske fænomener og proteindynamik, til indlæring og udvikling af metoder til brug af genomiske databaser med henblik på at identificere molekylære mål for udvikling af nye lægemidler;
• metabolomik.

Ph.d.-programmet er afhængig af samarbejdet mellem forskergrupper fra universiteterne i Utrecht, Frankfurt, Lyon og Oxford, blandt de vigtigste i verden inden for strukturel biologi.

Målet med kurset er at give en høj kvalitet og tværfaglig forskeruddannelse inden for strukturel biologi. For at opnå dette omfatter kurset et meget bredt integreret program, der omfatter ekspertise inden for kemi, biologi, biofysik, medicin og informatik, i stand til at løse de faktiske udfordringer på området lige fra grundlæggende problemstillinger til applikationer. En ny generation af doktorgradsstuderende vil blive uddannet til at overveje tværfaglig forskning, transnationalt samarbejde og integration af forskellige teknikker som primære behov for udvikling af fremragende forskning.

Strukturel biologi er nøglen til innovation inden for bioteknologi, fødevareteknologi og biomedicinske applikationer. Det spiller en stor rolle i forståelsen af terapeutikas virkningsmåde og letter design af innovative lægemidler og biologiske stoffer, der virker på specifikke molekylære mål. Startende med at bestemme tredimensionelle strukturer af makromolekyler, har strukturel biologi udviklet sig til studiet af makromolekyle dynamik og makromolekylære mekanismer, og sætte dem i cellulære sammenhænge. Det giver en visualisering på atomniveau af biomolekyler og deres funktionsmåde. Farmaceutiske virksomheder har strukturelle biologiafdelinger involveret i forskellige stadier af lægemiddelopdagelsespipelines. Faktisk er områder som informerede lægemidler og nye vacciner ofte afgørende afhængige af strukturelle data.

Større og større molekylære systemer og stadig mere komplekse biologiske fænomener forventes at blive afsløret i fremtiden gennem integrerede strukturbiologiske tilgange, der kombinerer komplementære eksperimentelle og beregningsmæssige værktøjer.

Kandidaterne vil blive uddannet mhp

• erhverve en solid fælles videnskabelig baggrund inden for strukturbiologi-området,
• modtage en avanceret og fokuseret infrastruktur-baseret træning-dog-forskning i deres forskningsmetodologi
• Deltage og fremme deres forskning i internationale konferencer
• formidle resultaterne af deres arbejde i internationale publikationer
• udvide deres horisont gennem en lang række kurser og seminarer
• stimulere tværfaglige samarbejder
• stimulere mobilitet og tværnationale samarbejder
• Få ikke-videnskabelige uddannelser for forbedrede karriereperspektiver
• udvikle sig til dygtige, fordomsfrie, uafhængige unge forskere.