Dette program udforsker de største religiøse traditioner i verden, herunder hinduisme og buddhisme, religionerne i Kina og Japan, jødedom, kristendom og islam. Den studerende skal fokusere på det akademiske studium af religion, med særlig opmærksomhed på: fælles dimensioner af religiøs erfaring; samspillet mellem religion og kultur; den teoretiske analyse af religiøs tro og erfaring; religiøst udtryk i myte, ritual, symbol og social organisation; religiøse reaktioner på arketypiske problemer med menneskelig erfaring.

Doktorgradsprogrammet i åndelig teologi med en minimumsvarighed på to år giver den studerende mulighed for at skrive en afhandling om et specifikt område af åndelig teologi under vejledning af en af instituttets professorer. Dette program forbereder også de studerende til undervisning på universitetsniveau.

Det pavelige pastorale institut "Redemptor Hominis" uddanner og specialiserer studerende i pastoral teologi: både i dets grundlæggende temaer (identitet og metode) og i relation til nogle specifikke områder af kirkelig aktivitet. Især forbereder den fremtidige lærere til undervisning i seminarier og teologiske institutter såvel som pastoralarbejdere, der er eksperter inden for de forskellige områder af det kirkelige liv. I lyset af en missionær fornyelse af kirken lægger instituttet særlig vægt på temaerne i Kirkens sociale doktrin, pastoral og sundhedspleje; og dialogen mellem teologi, samfundsvidenskab og humaniora.

Tredje cyklus er et specialiseret forskningsspor, der primært er målrettet dem, der ønsker at undervise og lave universitetsforskning.