Formålet med ph.d.-studier inden for praktisk og økumenisk teologi og teologisk etik er, at eleverne på den sædvanlige måde for avancerede studier dyrker deres evne til at tænke teologisk og fordybe deres viden om den teologiske tradition i dens økumeniske, praktiske, og etiske dimensioner på ekspertniveau. Eleverne lærer at kritisk analysere og reflektere over de opnåede viden og metoder, der anvendes inden for deres område og at fortolke dem både i deres egne specifikke sammenhænge og i de tværfaglige rammer for moderne videnskabelig viden. Afhængigt af deres dissertationsprojekt er deres studier fokuseret på den relevante specialisering inden for økumenisk eller praktisk teologi (for eksempel homiletik, kateketik, poimenik, praktisk ekklesiologi, hymnologi eller missiologi) eller på teologisk etik eller kristen socialt arbejde (diakonier). Samtidig opretholder de dog den passende synsvidde og tværfaglige orientering, der vedrører alle teologiske grene.

Formålet med ph.d.-studier inden for den historiske og systematiske teologi er, at de på den sædvanlige måde for avancerede studier dyrker deres evne til at tænke teologisk og uddybe deres viden om den teologiske tradition i sine historiske og systematiske dimensioner på en ekspert niveau. Eleverne lærer at kritisk analysere og reflektere over de opnåede viden og metoder, der anvendes inden for deres område og at fortolke dem både i deres egne specifikke sammenhænge og i de tværfaglige rammer for moderne videnskabelig viden. Afhængigt af emnet for deres afhandlingsprojekt er deres studier fokuseret på et specifikt specialiseret felt af historisk eller systematisk teologi (fx kirkehistorie, dogmes historie, systematisk teologi eller dogmatik), men samtidig bevarer de passende synsvidde og tværfaglig orientering, der vedrører alle teologiske grene.

Formålet med ph.d.-studier inden for bibelsk teologi er, at de studerende på sædvanlig vis for videregående studier opdyrker deres evne til at tænke teologisk og til at uddybe deres viden inden for de relevante bibelske teologiske discipliner på ekspertniveau. Feltet dækker alle aspekter af specialiststudiet af Bibelen, såsom teologiske, litterære og historiske faktorer. Studier fokuserer på enten Det Gamle Testamente eller Det Nye Testamente. De omfatter undersøgelse af bibelske tekster i deres relevans for religiøse og kulturelle traditioner. Afhængigt af det specifikke afhandlingsprojekt kan undersøgelser omhandle tekstlige, sproglige, litterære, litteraturhistoriske, historiografiske, religiøse eller kulturelle spørgsmål. Normalt skal de også rejse spørgsmål om Skriftens teologiske profil eller overordnede vidnesbyrd i forhold til relevante teologiske spørgsmål, og også beskæftige sig med spørgsmål om forståelse, kommunikation og fortolkning. Arbejdsområdet for bibelvidenskab omfatter også de beslægtede specialdiscipliner - for eksempel de antikke og klassiske sprogs filologi, litteraturen fra det antikke nære Østen og antikkens hovedkulturer, religionernes fænomenologi og studiet af religionerne i antikken, de relevante regioners arkæologi og historieskrivning – og også en refleksion over metodologier på det bibelske område, hermeneutiske problemstillinger og bibelforskningens historie og dens aktuelle tendenser. Studier er i passende grad knyttet til andre teologiske felter, og har ligesom andre grene af teologien en tværfaglig dimension.

Formålet med ph.d. Kurset er at forberede de studerende på både grundlæggende og anvendt forskning inden for informatik med henblik på andre videnskabelige discipliner forstået som en kreativ inspiration til forskning og udvikling af nye strukturer og algoritmer og deres endelige implementering.

Ph.D. inden for elektroteknik og informationsteknologi har som mål at forberede kandidater til videnskabeligt arbejde. Ved at opnå højere kvalifikationer, herunder kendskab til fremmedsprog, ph.d. kandidater vil øge deres karrieremuligheder markant. Studerende, der ønsker at fortsætte deres studier mod denne ph.d. kan vælge mellem 16 specialiseringsområder.

Doktorgradsprogrammet i radiologisk fysik er ret enestående og er det eneste inden for Tjekkiet, der forbereder kandidater til stillinger inden for radiodiagnostik, strålebehandling, nuklearmedicin og radiobiologi. Kursusprogrammet og emnerne i doktorafhandlinger er tæt knyttet til kandidatuddannelsen i radiologisk fysik, hvilket giver en mere dybtgående indsigt i specielle områder inden for radiologisk fysik.

Doktorgradsprogrammet i fysisk teknik forbereder sine kandidater til uafhængige kreative karrierer inden for tre nært beslægtede større videnskabelige og forskningsområder, nemlig Fysisk elektronik, Solid State Engineering og Materialets struktur og egenskaber.

Det nye studieprogram er fokuseret på nuklear sikkerhed i nukleare anlæg, nukleare materialer, kilder til ioniserende stråling og nuklear retsmedicin. Et unikt træk ved den nye ph.d. Programmet består i sammenhæng mellem nuklear sikkerhed i nukleare anlæg, nukleare materialer, kilder til ioniserende stråling og nuklear sikkerhed i nukleare anlæg og dens synergier. især inden for beredskab og retsmedicinske metoder, der anvendes inden for forskellige nukleare områder.

Programmet integrerer en bred vifte af videnskabelig og teknisk viden med fokus på avancerede dele af plasmafysik og relaterede teknologier. Udfordringen med at mestre den kontrollerede termonukleære fusion fremhæves i programmet.

Doktorgradsprogrammet i Quantum Technologies er et tværfagligt program, der retter sig mod uddannelse af topeksperter, der beskæftiger sig med forskning og videnskabsteknisk praksis inden for kvanteteknologier, især kvantefysik, information og kommunikation, kvanteoptik, lasere, faste stoffer, nanomaterialer, nanostrukturer og avancerede karakteriserings- og modelleringsmetoder.